心位于“肺下肝上”、“形如未开莲花”。“心为诸经之主……而血脉，脉气流于诸经”。“此一主者，气血之根，生化之本，十二经之网维”。“人心动，则血行于诸经”。所谓肺下肝上，是指心脏居胸腔，大如拳。“左右有肺”，“心尖略向左”，“色赤而鲜”，“体外圆滑，内腔如囊，中有横直膈膜相隔如户如房”，心脏主持血液循环。以肝的疏泄阳气，肾脏的阴精上交于心，借着自然界的诸阳之气渗透于中，转化为心气，在心气的鼓动和神明的调节下，使心脏不断地发生节奏性跳动，将血液输入血脉，循环于机体，然后由全身各处汇集的“各经之血，无不上会于肺”，从而构成机体的大小循环，担负着“食气入胃，浊气（精气）归心，淫经于脉，脉气流经，经气归于肺”，“肺主呼吸，司清浊之运化”的任务，保证了人的正常的生理活动。
心与其他脏腑的关系 心与肺。心肺为阳，同居于胸中膈上，肺主气，心主血，气血相依，相互为用，相互促进，构成气得以濡之，血得以煦之的生理活动。气机所动受血液滋养而不亢不燥，推行血液循环于全身，内濡脏腑，外养四肢百骸；血赖气的熏蒸而动，循行不息，从而形成肺主气，以呼吸清浊，推行营卫，施布津液；心主血，以运行营养物质，供机体生理之用，此谓：“心主血，肺主气，血为营，气为卫。
相随上下，调之营卫，通行经络，营周于外，故令人心肺在膈上也。
”心与脾。心居胸上处于上焦，脾居于腹处于中焦，以募原和脾支脉构成气化机能之用。心阳和营精下济于脾，则脾气得充，阴精得助，阴阳相交则转化为元气。元气生，则中轴得定，运化之机得畅，胃气得行，升降机能得以斡旋于上下。水谷得化，津液以布脾血得以统运，营气以行，上布于心，心营得资，心体得养，则神气安宁，血气乃和，此谓“心之脾胃”之用的机理。
心与肝。心与肝的生理关系是以气血为用的，因肝脉的分支络于肺，吻合于心脉，则成“心肝气通”。
心主营运的血液藏于肝，肝体阴用阳，其性刚劲，主动，主升，得心输其血精以濡润之，刚劲之质得以柔和之体，以布升发之阳，此谓“阳潜于阴、阴出于阳”之理；肝体柔和，生阳畅茂，疏泄之机得通，心受其气，则心气得充，心阳得助，血液得行，营卫得布，津液得散，机体得养，脏腑得滋。
此为“清净之气……生于肝……役于心”之义。
心与肾。肾的支脉，络于心脏，以成心肾相交，升降相因，阴阳相济的关系。心阳转化为心气，是以肾阴上交于心，则阳得阴而化。心气温润、血液得行，此为心阳动而火不亢。肾阳转化为肾气，是以心阳下济于肾，则肾阴得阳而生，肾之真气，上通脏腑，以为生理之用，此为心肾相交之理。
心与小肠。心是从少阴之脉络于小肠，而小肠经脉也络于心。因而构成心与小肠在生理上互为表里，阴阳互用。心为阴火为君而主静；小肠为阳火为相主动，动静相合则蒸精化液而生冲和之气。
因此，心有此气则心动不疾不徐，以行血液循环之用，其脉乃调，神则内藏，心动有节，以营、精、津，注入机体，脏腑得润，皮、毛、筋、骨得濡；小肠得此气，则行受盛之用。以济泌别，上供心脏之需，内滋心火；下济它脏它腑，以滋身体，则生理活动若一。
心与胆。心与胆相通，心为君火“经与上生于下”而为阴，阴主静，静则为柔；胆为相火，位于下而为阳，阳主动，动则为刚，从而在生理上形成刚柔相济，阴阳互化升降相关，清浊已分，清浊之间是为少阳升阳之气。而升阳之气以助中气（木疏于土则运）。中气者，阴阳升降之轴，气血循行之枢。少阳升发之气借此枢轴上升于心，则心阳有助，心气有资，以行于血，血得煦，则营运于精、气、津以供生理之需；君火之气借此枢轴下降于胆，则胆之少阳升发之气得血以濡之，津以润之。虽为相火之体，而其气不燥而生冲和之气以供之用，故《素问·调经论》说：“五脏之道，皆出于经隧，以行血气。”黄坤载亦说：“阴阳则有清浊，清则浮升，浊则沉降，自然之性……，清浊之间是为中气者，阴阳升降之枢轴。”此即所谓心病治胆，胆病治心的道理。
综观上述，心与五脏六腑生理功能是相互为用的，故心病则神摇，神动则脏腑不安，心神不宁而疾甚矣。故《推求师意》说：“心动则心之所以为病，病则有因，因者，内外之邪所致。”一为先天所致。因先天禀赋不足，心内如房如户之体不全，而引起血行不畅，内蓄瘀血于第二卷１６３心，瘀血内结，血不舍神则神气外浮而成心悸、怔忡之患。
